これら 2 つの毒性はまったく異なるメカニズムで作用するため、研究者らは別々に取り組みました。 神経毒をブロックする 神経毒性のあるスリーフィンガータンパク質は、主要な神経伝達物質であるアセチルコリンの受容体に結合してブロックすることに特化した、より大きなタンパク質ファミリーのサブグループです。これらの受容体に結合する能力の鍵となるその三次元構造は、タンパク質内で互いに寄り添う 3 本のアミノ酸列に基づいています (十分に高度な生物学の授業を受けた人にとって、これらは逆平行です)ベータシート）。そこで、これらの毒素を妨害するために、研究者らはこれらの文字列をターゲットにしました。 彼らは、RFdiffusion と呼ばれる AI パッケージに依存していました (RF は、Rosetta Fold タンパク質折り畳みソフトウェアとの関係を示しています)。 RF 拡散は、特定の化学物質を補うタンパク質構造の設計に向けることができます。この場合、スリーフィンガー毒素の鎖の端に沿って並ぶ可能性のある新しい鎖が特定されました。それらが特定されると、ProteinMPNN と呼ばれる別の AI […]
