AIは、プラスチックを使うことができるマルチステージ酵素の設計に使用されています

AIは、プラスチックを使うことができるマルチステージ酵素の設計に使用されています

そしてそれはうまくいきました。プレーサースクリーニングの追加ステップで同じプロセスを繰り返すと、触媒活性を持つ酵素の数が3回以上増加しました。

残念ながら、これらの酵素はすべて、単一の反応の後に停止しました。彼らはエステルの切断ではるかに優れていることが判明したが、酵素に化学的に関連する部分を残した。言い換えれば、酵素は触媒ではなく、反応の一部として機能しました。したがって、科学者は、重要な移行の反応状態を受け入れる可能性のある構造をスクリーニングするためにプレーサーを使用し始めました。これにより、はるかに高度な反応性酵素(エステルの結合の18%)がもたらされ、「スーパー」と「勝利」と呼ばれる2つは、実際に数回の反応を経ることができました。チームは最終的に酵素を作成しました。

RFDifusionとスクリーニングを交互に交互に追加する追加のホイールを追加することにより、プレーサーチームは機能的酵素の頻度が増加することを見て、最終的には実際の生物と同様の活性を持つ活性を示唆しました。彼らはまた、同じプロセスを使用して、ペット、一般的なプラスチックでバインディングを消化できるエステラーゼを設計できることを示しました。

それが多くの仕事のように聞こえるなら、それは明らかに – 酵素の指定、特に私たちが生物の類似の酵素について知っているものは、深刻な課題のままです。少なくともこれは、酵素をコードするDNAを注文し、それを達成するために細菌を持ち込み、活動のスクリーニングを誰かに要求するのではなく、コンピューターで作成できます。また、既知の酵素への参照を含むプロセスにもかかわらず、設計された酵素は、それらと共通の多くのシーケンスを共有しませんでした。これは、生きているものが一度も遭遇していないエステルに反応するものを設計したい場合、柔軟性を追加する必要があることを示唆しています。

生存に必要な酵素を設計し、それを細菌に入れて、しばらくの間発達させることができた場合、私は何が起こるかについて興味があります。人生は私たちの最良の提案を改善する方法を見つけることができると思われます。

Science、2024。Doi:10.1126/Science.Adu2454(O DOI)。

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